دو فاکتور مهم در کشک پروتئین‌ها و کلسیم هستند؛ با توجه به این‌که برای تولید کشک شیر و ماست تلغیظ می‌شود درصد پروتئین‌های ان افزایش می‌یابد و این موضوع (افزایش پروتئین) ممکن است تا ۵۰ درصد در کشک‌های خشک برسد. در کشک مایع صنعتی میزان پروتئین ممکن است ۸ درصد باشد و یا تا ۱۳ درصد هم افزایش پیدا کند. بنابراین اگر کشک خشک را کارخانجات صنعتی تولید کنند به مراتب به‌دلیل وجود پروتئین بالا و بهداشتی بودن ارزش غذایی بهتری هم دارد. البته کشک‌های مایع صنعتی هم بسیار خوب و باکیفیت هستند.

علاوه بر پروتئین کلسیم بالای کشک یکی از مهم ترین مزایای غذایی این محصول است که حتی با حرارت دادن کاهش پیدا نمی‌کند، کشک منبعی برای تأمین ویتامین نیست و به‌همین دلیل حرارت دادن ماست برای به‌دست اوردن کشک تأثیری بر از دست رفتن مواد مغذی ندارد و مهمترین مواد یعنی پروتئین و کلسیم در کشک باقی می‌مانند. تنها نکته‌ای که وجود دارد این است که هر اندازه میزان نمک کشک بیشتر باشد میزان جذب کلسیم کمتر می‌شود اما در واقع این تأثیر هم خیلی زیاد نیست.

میزان کلسیم کشک بسیار بالا است به‌طوری که اگر فرد در روز ۱۰۰ گرم از کشک استفاده کند نیاز روزانه کلسیم خود را تأمین کرده است. بسیاری از ویتامین‌هایی که در شیر موجود است در کشک هم وجود دارد. به‌طور مثال منبع خوبی از ویتامین‌های گروه ب است اما بیشترین ارزش غذایی کشک به‌دلیل وجود پروتئین بالا، کلسیم و فسفر ان است. اگرچه مواد دیگری نظیر سدیم و پتاسیم در ترکیبات کشک موجود است.